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Edwards DNA 提取法(中文翻译)
一、方法概述
Edwards DNA isolation – for strawberry or Arabidopsis
该方法可获得适用于基因分型 PCR 的 DNA。
本步目的:说明这是一个偏快速、实用型的植物基因组 DNA 提取方法,重点在于服务后续 PCR 检测,而非获得超高纯度 DNA。
二、Edwards buffer 配方
| 组分 | 终浓度 |
| Tris-HCl, pH 7.5 | 200 mM |
| NaCl | 250 mM |
| EDTA | 25 mM |
| SDS | 0.5% (w/v) |
你提供的 protocols.io 截图还给出了一个 100 mL 配方参考:Tris 3.15 g、EDTA 0.93 g、NaCl 1.46 g、SDS 0.5 g;先用 HCl 调至 pH 8,再补足体积,最后加入 SDS。手写稿只写了终浓度,我在此将两者都保留为参考信息。
本步目的:提供裂解和保护 DNA 所需的基础缓冲体系:Tris 稳定 pH,EDTA 螯合金属离子抑制核酸酶,NaCl 维持离子强度,SDS 裂解细胞并促使蛋白变性。
三、DNA 提取流程
- 取一小块幼嫩叶片(手写示意为很小的一片,适合 1.5 mL 管操作),放入 1.5 mL 离心管中。
本步目的:选择较嫩、细胞活跃且组织量适中的材料,既利于裂解,也避免样品过多导致杂质增加。
- 用小号蓝色研磨杵初步研磨。
本步目的:先机械破碎组织,增加后续缓冲液接触面积。
- 加入 400 µL Edwards buffer。
本步目的:开始化学裂解并将 DNA 释放到溶液中。
- 继续研磨,直到看不到明显大块组织残片。
本步目的:尽可能充分裂解组织,提高 DNA 释放效率。
- 室温孵育约 15 min。
本步目的:给裂解和溶出过程足够时间,使 DNA 更充分进入上清液。
- 13,000 rpm 离心 5 min。
本步目的:沉降细胞碎片和大颗粒杂质,便于收集含 DNA 的上清。
- 转移约 300 µL 上清到新管中。
本步目的:分离 DNA 溶液与沉淀/残渣,减少后续杂质带入。
- 加入 300 µL isopropanol,轻轻颠倒混匀。
本步目的:用异丙醇沉淀 DNA。
- 室温孵育 5 min。
本步目的:给 DNA 聚集沉淀充分时间。
- 再次以约 13,000 rpm 离心 5 min。
本步目的:将 DNA 沉淀收集到底部。
- 倒掉上清。
本步目的:去除沉淀液体相,保留 DNA pellet。
- 短暂离心约 10 s,使残余液滴集中到底部;用移液器吸尽后,在 37 °C 培养箱中完全晾干约 10 min。
本步目的:清除残余异丙醇,避免抑制后续 PCR;但需避免过度干燥导致 DNA 难以重悬。
- 加入 50 µL 蒸馏水(distilled H2O)重悬,4 °C 保存。
本步目的:将 DNA 重新溶解,得到可储存、可使用的模板液。
- 若条件允许,使用前可放置过夜以帮助充分重悬。
本步目的:让沉淀 DNA 更完全溶解,提升使用一致性。
四、PCR 使用建议
手写稿右下角标注:Dilute 1:10 for PCR。
本步目的:适度稀释模板可降低杂质、盐和残留表面活性剂对 PCR 的抑制效应,提高扩增稳定性。
五、说明
注:该文档源文件并非规范排版的文本协议,而是嵌入图片,因此个别细节只能按图片可读内容重建。若你之后拿到原始网页链接或更高清扫描稿,我还可以再帮你做一次更严格的校订版。