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Edwards DNA 提取法(中文翻译)

原始文档:DNA isolation for genotyping_Dongdong.docx

来源情况:该 docx 主体为嵌入图片,不是普通可编辑文字。我依据文档内手写协议照片,并参考你提供的 protocols.io 截图,对流程进行了忠实重建与中文整理。

适用对象:草莓或拟南芥;原手写说明强调其适合用于 genotyping PCR。

一、方法概述

Edwards DNA isolation – for strawberry or Arabidopsis

该方法可获得适用于基因分型 PCR 的 DNA。

本步目的:说明这是一个偏快速、实用型的植物基因组 DNA 提取方法,重点在于服务后续 PCR 检测,而非获得超高纯度 DNA。

二、Edwards buffer 配方

组分终浓度
Tris-HCl, pH 7.5200 mM
NaCl250 mM
EDTA25 mM
SDS0.5% (w/v)

你提供的 protocols.io 截图还给出了一个 100 mL 配方参考:Tris 3.15 g、EDTA 0.93 g、NaCl 1.46 g、SDS 0.5 g;先用 HCl 调至 pH 8,再补足体积,最后加入 SDS。手写稿只写了终浓度,我在此将两者都保留为参考信息。

本步目的:提供裂解和保护 DNA 所需的基础缓冲体系:Tris 稳定 pH,EDTA 螯合金属离子抑制核酸酶,NaCl 维持离子强度,SDS 裂解细胞并促使蛋白变性。

三、DNA 提取流程

  1. 取一小块幼嫩叶片(手写示意为很小的一片,适合 1.5 mL 管操作),放入 1.5 mL 离心管中。
    本步目的:选择较嫩、细胞活跃且组织量适中的材料,既利于裂解,也避免样品过多导致杂质增加。
  2. 用小号蓝色研磨杵初步研磨。
    本步目的:先机械破碎组织,增加后续缓冲液接触面积。
  3. 加入 400 µL Edwards buffer。
    本步目的:开始化学裂解并将 DNA 释放到溶液中。
  4. 继续研磨,直到看不到明显大块组织残片。
    本步目的:尽可能充分裂解组织,提高 DNA 释放效率。
  5. 室温孵育约 15 min。
    本步目的:给裂解和溶出过程足够时间,使 DNA 更充分进入上清液。
  6. 13,000 rpm 离心 5 min。
    本步目的:沉降细胞碎片和大颗粒杂质,便于收集含 DNA 的上清。
  7. 转移约 300 µL 上清到新管中。
    本步目的:分离 DNA 溶液与沉淀/残渣,减少后续杂质带入。
  8. 加入 300 µL isopropanol,轻轻颠倒混匀。
    本步目的:用异丙醇沉淀 DNA。
  9. 室温孵育 5 min。
    本步目的:给 DNA 聚集沉淀充分时间。
  10. 再次以约 13,000 rpm 离心 5 min。
    本步目的:将 DNA 沉淀收集到底部。
  11. 倒掉上清。
    本步目的:去除沉淀液体相,保留 DNA pellet。
  12. 短暂离心约 10 s,使残余液滴集中到底部;用移液器吸尽后,在 37 °C 培养箱中完全晾干约 10 min。
    本步目的:清除残余异丙醇,避免抑制后续 PCR;但需避免过度干燥导致 DNA 难以重悬。
  13. 加入 50 µL 蒸馏水(distilled H2O)重悬,4 °C 保存。
    本步目的:将 DNA 重新溶解,得到可储存、可使用的模板液。
  14. 若条件允许,使用前可放置过夜以帮助充分重悬。
    本步目的:让沉淀 DNA 更完全溶解,提升使用一致性。

四、PCR 使用建议

手写稿右下角标注:Dilute 1:10 for PCR

本步目的:适度稀释模板可降低杂质、盐和残留表面活性剂对 PCR 的抑制效应,提高扩增稳定性。

五、说明

注:该文档源文件并非规范排版的文本协议,而是嵌入图片,因此个别细节只能按图片可读内容重建。若你之后拿到原始网页链接或更高清扫描稿,我还可以再帮你做一次更严格的校订版。